Tico brilla en Cambridge: proyecto ayuda a descubrir nuevos fármacos

Carlos Cruz-Castillo, un costarricense originario de Belén, Heredia, lidera desde Cambridge, Inglaterra el desarrollo de una herramienta digital innovadora que acelera el descubrimiento de nuevos medicamentos. 

Cruz-Castillo destaca por trabajar en el Instituto Europeo de Bioinformática (EMBL-EBI), uno de los centros de investigación más prestigiosos del mundo.

Colabora con científicos de instituciones académicas y con la industria farmacéutica a través de Open Targets, una colaboración público-privada que desarrolla una plataforma de recursos genómicos para facilitar el descubrimiento de fármacos.

A pesar de no tener formación universitaria formal, Cruz se abrió paso en el campo de la bioinformática gracias a su experiencia en programación y el impulso de mentores como el investigador Allan Orozco, pionero en la disciplina en Costa Rica.

Actualmente, Cruz colabora con otros costarricenses como Antonio Solano, quien también realiza importantes aportes en el área.

Hoy, su trabajo como ingeniero líder de front-end tiene impacto internacional y apoya la búsqueda de tratamientos para enfermedades que afectan a millones de personas.

Sobre el proyecto

El proyecto se desarrolló durante 2024 y se llama Associations on the Fly. Se trata de una herramienta web que permite explorar en tiempo real la relación entre genes y enfermedades.

“Associations on the Fly es una herramienta que permite a los científicos ajustar en tiempo real los pesos de diferentes fuentes de evidencia científica para personalizar las puntuaciones de asociación gen-enfermedad. Antes, los investigadores tenían que usar básicamente lo que nosotros teníamos preconfigurado, ahora pueden personalizar los algoritmos de puntuación según sus necesidades específicas“, explicó Cruz.

Científicos de todo el mundo utilizan genética humana y datos genómicos para identificar y priorizar sistemáticamente blancos terapéuticos, con el objetivo de mejorar las tasas de éxito en el desarrollo de nuevos medicamentos. 

La plataforma de Open Targets recopila más de 7.8 millones de asociaciones gen-enfermedad. La herramienta AotF, que complementa esta plataforma principal permitiendo la personalización de algoritmos de puntuación, ha sido publicada recientemente en Oxford Bioinformatics, una de las revistas científicas más importantes del área.

Carlos también sueña con llevar más proyectos de bioinformática a Costa Rica. 

“Esta herramienta es de código abierto. Cualquier persona en el mundo la puede usar, incluso investigadores en Costa Rica“, explicó Carlos.

El sitio web utiliza arquitectura web moderna que permite interactividad en tiempo real, es gratuito, y permite a investigadores, médicos y estudiantes consultar información crucial en segundos. Cruz resalta que su objetivo es democratizar el acceso al conocimiento y facilitar la colaboración científica.

Su trabajo facilita la colaboración entre la academia y la industria bajo un modelo donde todos los datos experimentales se comparten abiertamente para beneficiar a la comunidad científica global.

“No todos estamos hechos para una vida académica. A veces, salirse del camino trazado es lo que realmente te lleva lejos“, afirmó.

Desde uno de los centros más avanzados del mundo, demuestra que el talento y la curiosidad pueden abrirse paso y destacar incluso fuera del país.