A Elías Aguilar le llega la oportunidad que tanto estaba esperando en la Selección Nacional.
Sus condiciones futbolísticas nadie las discute, con la tenencia de balón, movilidad, inteligencia en el campo de juego y remate de larga distancia, pero en la Tricolor no se le dieron las cosas las veces que fue convocado.
Algunos dicen que le afectó no haber compartido con el equipo titular, ya que la mayoría de veces jugó con cuadros alternativos o bien ingresaba de cambio cuando las cosas estaban cuesta arriba.
Su última vez en la Sele fue en la Copa Uncaf, en enero de 2017 en Panamá. En esa oportunidad el rendimiento del combinado nacional fue muy criticado y estuvo muy lejos del título; por ende, la mayoría de sus futbolistas fueron cuestionados por su bajo nivel, entre ellos Elías Aguilar.
El volante es uno de los llamados a cargar con el juego ofensivo de la Nacional desde la media cancha y está en él aprovechar esta nueva ocasión
El creativo milita actualmente en el Incheon United FC, donde ha sido regular.